甲状腺结节选择药物治疗，基本上没有办法能够让结节彻底消除。针对引起局部症状或已经威胁到患者的生命安全，则采取手术治疗。
另外，结节外观以及细胞学穿刺检测提示，可疑有恶性象征或已经确定是恶性，也需要及时手术治疗。
单纯甲状腺结节，无特殊症状的情况下，可以动态观察。
甲状腺结节的手术基本原则，主要根据甲状腺结节的大小以及分级，一般如果分级在三级、直径超过三公分以上或者出现压迫症状时，可以考虑行甲状腺大部切除手术治疗。
如果分级在4级以上，直径超过1.5公分以上时，就可以考虑行甲状腺大部切除切除手术治疗，无论是3级、4级行甲状腺大部切除，必须送术中冰冻，排除甲状腺癌的可能。如果四级以上术中冰冻证实为甲状腺癌，通常需要加做甲状腺癌根治切除手术治疗。
如果甲状腺结节明显增大，有压迫症状导致声音嘶哑，咽喉部的疼痛不适，可以需要手术治疗。还有一种情况就是甲状腺结节伴有钙化或者边界不清，纵横比大于一，就需要穿刺活检以确定性质。
如果是恶性的，也需要手术治疗。如果甲状腺结节并不大，而且是多发没有症状，就可以定期复查就可以。当然需要少摄入海产品，也就是要低碘饮食。
甲状腺结节的手术一般分为两种情况，对于良性的甲状腺结节，可以采取甲状腺结节单纯切除手术，或者是局部的甲状腺腺叶进行清除.
而对于甲状腺结节考虑有恶性变，甲状腺癌的可能，最好是采取甲状腺大部分或者是全部切除，同时还要对所在肿瘤部位的中央区淋巴结进行清扫，术后根据病理类型及相应的病情变化，采取碘131放疗的可能性来综合治疗甲状腺结节。
对于甲状腺可疑的结节，可以选择手术治疗，一般选择腺叶及峡部切除，并做快速的病理检查。
结节位于峡部时，应该以活检证实两侧均为正常的甲状腺组织；如果结节为恶性结节，应该以部分甲状腺切除，甚至全甲状腺切除术，并且清扫区域淋巴结是否有转移，具体的手术于病理类型以及临床分期密切相关。
