对于严重腹泻的患者，首先应暂时停止进食，使用药物来进行治疗，常用药物有止泻药，例如蒙脱石散，蒙脱石散可以起到中和肠道毒素，吸附肠道过多水分，缩短病程的功效，同时，还可以服用洛哌丁胺，抑制肠道蠕动，达到治疗腹泻的目的。
此外，腹泻严重时，患者还需要使用肠道益生菌来进行治疗，例如复方嗜酸乳杆菌等，当然，最重要的治疗是针对原发病进行治疗，对于感染因素所导致的腹泻，应积极使用抗感染药物。
