肺结核的疗程长短主要取决于肺结核治疗的情况，以及有无耐药结核的存在，有无并发症等。例如对于初治的肺结核或结核性胸膜炎患者，予以有效的抗结核治疗，其疗程通常在9个月左右。
对于复治的肺结核患者，其结核治疗时间要明显延长，通常在一年左右。而对于具有多重耐药的肺结核，此时时间在一年半到两年，故肺结核的疗程要具体情况具体分析其治疗时间。
根据痰检情况及既往治疗情况，肺结核分好多种。不同种类的肺结核，治疗时间不一样。针对初治涂阳的肺结核治疗，至少要半年。
前面两个月用4种药，异烟肼、利福平，吡嗪酰胺，乙氨丁醇、后面4个月用异烟肼、利福平。针对复治涂阳的肺结核，治疗需要半年到8个月。针对耐药肺结核治疗，需要一两年或更长时间。
肺结核治疗疗程至少半年以上，有些治疗了半年，但患者仍有咳嗽咳痰，胸闷，气喘的临床症状，肺部病灶没有完全吸收或者合并结核性胸膜炎、结核性脑膜炎、骨结核，治疗的疗程要达到一年以上的时间，使体内的结核杆菌彻底杀死。
同时，要加强对症支持处理，加强营养，进食一些优质高蛋白的食物。
